Mata kuliah Struktur dan Perkembangan Hewan 2 merupakan mata kuliah lanjutan dari mata kuliah Struktur dan Perkembangan Hewan 1 dengan materi ontogeni dan perkembangan hewan mulai dari zigot sampai dengan organogenesis dan terbentuknya embrio. Bahasan materi pembelajaran mata kuliah Struktur dan Perkembangan Hewan 2 ini terdiri atas: 1) gametogenesis: spermatogenesis, oogenesis, macam-macam tipe telur, siklus reproduksi, 2) fertilisasi: syarat-syarat dan mekanisme fertilisasi, partenogenesis, kembar, 3) segmentasi dan blastulasi: tipe-tipe pembelahan; mekanisme pembelahan zigot beberapa vertebrata, pembentukan blastula, tipe-tipe blastula, 4) gastrulasi: tujuan dan proses gastrulasi, 5) neurulasi: tujuan, proses neurulasi, differensiasi, 6) selaput ekstraembrio: fungsi, proses pembentukan selaput ekstraembrio, 7) implantasi dan plasentasi: pengertian, proses implantasi, tipe- tipe implantasi, fungsi plasenta, tipe-tipe plasenta, proses pembentukan plasenta, 8) organogenesis: induksi embrionik, proses pembentukan organ-organ derivat ekstoderm, mesoderm dan endoderm, 9) metamorforsis: pengertian stadium larva, proses metamorforsis pada amphibia, dan 10) regenerasi: macam- macam regenerasi, mekanisme proses regenerasi, faktor-faktor pemicu regenerasi. Selain kegiatan pembelajaran di kelas, Mata kuliah ini juga dilaksanakan melalui praktikum sebagai bentuk pembelajaran inkuiri.